В мае 1941 была передислоцирована из Лиды в район Гродно и расположилась на правом фланге частей округа, на стыке с ПрибОВО.

Командовал дивизией генерал майор Сахнов С.П. который была назначен командиром соединения 12 июня и прибыл к месту назначения только 16 июня.

На 22.06.1941 года дислоцировалась в непосредственной близости от границы: 213сп в лагерях в районе Сопоцкина, 37сп в районе деревни Красное, развед. бат. в Августовском лесу на берегу канала, 247 гап в районе местечка Святск-Вельки, там же находился и штаб дивизии.

В 3 часа утра 22.06.41 213 сп был поднят по тревоге и занял оборону по берегам Августовского канала. На 22.06.1941 — 24.06.1941 дивизия обороняясь по фронту 40 км. Попав под удар трёх пехотных дивизий (8АК - 161,28 и 8 пд) противника, была рассечена на части и организационно разгромлена, бои сразу приняли очаговый характер. К 6.00 передовой отряд противника прорвался к штабу 56-й стрелковой дивизии, управление штаба было рассеяно, генерал-майор С. П. Сахнов чудом спасся. Управление дивизии, оказавшееся в тылу противника, разбилось на 2 группы, при этом группа во главе с комдивом в течение следующего дня 23 июня отходила на Озеры. Остатки 37-го стрелкового полка отступили к г. Сокулка, 184-й Краснознамённый стрелковый полк — на правый берег Немана севернее Гродно. 213-й стрелковый полк, заняв недостроенные доты и полевые укрепления на рубеже Августовского канала, напротив д. Соничи, двое суток в круговой обороне сдерживал натиск противника. 24 июня внезапным ударом прорвал окружение и по захваченному понтонному мосту переправился через Неман. 4 июля после рейда по тылам противника был вынужден принять бой у деревень Гуды и Липнишки Лидского района, в ходе которого был полностью уничтожен.

В 247-м гаубичном полку к 5 часам 22.06.1941 года из 36 гаубиц осталось несколько штук, остатки полка начали отход к Неману. Вечером из 1240 человек до Гродно дошли 78. В ночь на 23.06.1941 года остатки полка двинулись в направлении Лиды, на марше полк неоднократно подвергался бомбежке, в результате личный состав лишился последних орудий.

На 24.06.1941 представляла собой всего два сборных отряда, численностью по 700—800 человек, по словам командарма В. И. Кузнецова представляя собой «всего лишь номер».

С 24.06.1941 — 26.06.1941 сводные отряды удерживали противника на р. Котря, после отходили в сторону Лиды и Мосты. Остатки отходивших частей с рубежа р. Котря 27 июня вышли к переправам через Неман в районе Мосты. Не всем удалось переправиться на южный берег где находились части отходившей от Гродно 3А Кузнецова. Мост из-за угрозы захвата его противником пришлось взорвать и остаткам наших частей пришлось переправлять на подручных средствах. Танки и артиллерия 11МК поддерживала переправляющиеся части огнем артиллерии и танков.

На этом историю 56сд можно считать законченной. Официально дивизия расформирована 19.09.1941 года.